Mitä tietää
- FNA-tiedosto on FASTA-muotoinen DNA- ja proteiinisekvenssikohdistustiedosto.
- Avaa yksi Geneiousilla.
- Muunna FASTA-muotoon ja vastaaviin muotoihin samalla ohjelmalla.
Tässä artikkelissa kerrotaan, mitä FNA-tiedostot ovat, kuinka ne avataan ja miten ne tallennetaan eri muodossa, kuten FASTA, GB, VCF, kuvat jne.
Mikä on FNA-tiedosto?
FNA-tiedostotunniste on FASTA-muotoinen DNA- ja proteiinisekvenssikohdistustiedosto, joka tallentaa DNA-tietoja, joita molekyylibiologian ohjelmistot voivat käyttää. Erityisesti FNA-tiedostoja voidaan käyttää sisältämään vain nukleiinihappotietoja, kun taas muut FASTA-muodot sisältävät muuta DNA:han liittyvää tietoa, kuten FASTA, FAS, FA, FFN, FAA, FRN, MPFA, SEQ, NET tai AA. tiedostopäätteet. Nämä tekstipohjaiset FASTA-formaatit ovat peräisin samannimisestä ohjelmistopaketista, mutta niitä käytetään nykyään vakiona DNA- ja proteiinisekvenssien kohdistussovelluksissa.
Kuinka avata FNA-tiedosto
FNA-tiedostoja voidaan avata Windows-, Mac- ja Linux-käyttöjärjestelmissä Geneiousin avulla (se on ilmainen 14 päivää). Siirry kohtaan Tiedosto > Tuonti -valikosta ja valitse tuodaksesi FNA-tiedoston Tiedostosta valikon kohta. Voit myös pystyä avaamaan FNA-tiedostoja BLAST Ring Image Generatorilla (BRIG). Jos yllä olevat ideat eivät toimi, yritä avata se Notepad++:lla tai toisella tekstieditorilla. Tiedosto voi todellakin olla tekstipohjainen ja helppolukuinen, tai sillä ei voi olla mitään tekemistä FASTA-muodon kanssa. Siinä tapauksessa tiedoston avaaminen tekstiasiakirjana saattaa paljastaa tekstiä, joka tunnistaa, mitä tiedostoa on luotu tai missä muodossa tiedosto on. Jos huomaat, että tietokoneesi sovellus yrittää avata FNA-tiedoston, mutta se on väärä sovellus, tai jos haluat mieluummin toisen asennetun ohjelman avaavan FNA-tiedostot, voit käyttää oletusohjelmaa tietylle tiedostotunnisteelle Windowsissa.
Kuinka muuntaa FNA-tiedosto
Emme voi vahvistaa tätä, koska emme ole kokeilleet sitä, mutta sinun pitäisi pystyä käyttämään Geneiousta muuntamaan FNA-tiedosto moniin muihin muotoihin, kuten FASTA, GB, GENEIOUS, MEG, ACE, CSV, NEX, PHY, SAM. , TSV ja VCF. Tämä voidaan tehdä ohjelmien kautta Tiedosto > Viedä valikosta. Geneiousin pitäisi myös pystyä muuttamaan tiedosto PNG-, JPG-, EPS- tai PDF-muotoon Tiedosto > Tallenna kuvatiedostona. Vaikka et tavallisesti voi vain nimetä tiedoston tunnistetta uudelleen joksikin muuksi ja odottaa sen toimivan samalla tavalla, voi nimeä .FNA-tiedosto uudelleen .FA-tiedostoksi, jos tietty DNA-sekvensointiohjelmisto tunnistaa vain FA-muodon. Tiedostotunnisteiden uudelleennimeämisen sijaan sinun kannattaa käyttää ilmaista tiedostomuunninta muiden tiedostotyyppien muuntamiseen. FNA- ja FA-tiedostojen tapauksessa jotkin ohjelmat avaavat vain tiedostoja, joilla on FA-tiedostotunniste, jolloin niiden uudelleennimeämisen pitäisi toimia hyvin.
Etkö vieläkään voi avata sitä?
Jos et vieläkään voi avata tiedostoa yllä olevien ohjelmien käytön jälkeen, tiedostopääte ei välttämättä lue .FNA:ta, vaan sen sijaan jotain vain näyttää vertailukelpoinen. Esimerkiksi FNG (Font Navigator Group) -tiedostot näyttävät hyvin samanlaisilta kuin ne sanoisivat «.FNA», mutta jos katsot tarkasti, vain kaksi ensimmäistä kirjainta ovat samat. Koska tiedostopäätteet ovat erilaisia, tämä on merkki siitä, että ne ovat eri tiedostomuodossa eivätkä todennäköisesti toimi samojen ohjelmien kanssa. Sama voidaan sanoa monista muista tiedostopäätteistä, kuten FAX, FAS (Compiled Fast-Load AutoLISP), FAT, FNTA (Aleph One Font), FNC (Vue Functions) ja FND (Windowsin tallennettu haku). Ajatuksena tässä on varmistaa, että tiedostotunniste on .FNA. Jos näin on, yritä käyttää yllä olevia ohjelmia uudelleen avataksesi tai muuntaaksesi sen. Jos sinulla on toisenlainen tiedosto, tutki tiedostopäätettä saadaksesi selville, mitä sovelluksia sen avaamiseen tai muuntamiseen tarvitaan. FAQ
-
Kuinka avata FNA-tiedosto Pythonissa?
Muunna ensin FNA-tiedosto FASTA-muotoon käyttämällä kolmannen osapuolen sovellusta, kuten Geneious. Sitten voit ladata Biopythonin, joukon ilmaiseksi saatavilla olevia biologisia laskentatyökaluja bioinformatiikan työhön. Katso lopuksi Biopython-opetusohjelmasta ja keittokirjasta ohjeet FASTA-tiedostojen käsittelyyn.
-
Kuinka löydän FNA-valmistajan numerot raaka-Ancestry-tiedostosta?
Voit ladata suurimman osan DNA-tiedoista osoitteesta Ancestry.com .txt-muodossa. VCF-tiedoston lataaminen on kuitenkin mahdollista vain asiakkaille, joiden DNA on analysoitu seuraavan sukupolven sekvensoinnilla (NGS). VCF-tiedoston lataaminen edellyttää DNA:n omistajaa, DNA-testausta NGS-tekniikalla ja vähintään 350 Mt vapaata tilaa laitteellasi.